В 1934 году в музее было всего 530 экспонатов. Сегодня их число превышает 50 тысяч. За девяносто лет крошечная выставка достижений народного хозяйства превратилась в крупнейшее музейное собрание страны.
Музей был основан указом ЦИК и СНК СССР в 1934 году и долгое время носил имя персидского художника-миниатюриста Камаладдина Бехзода. В марте 2013 года в Душанбе открылось новое здание, и музей получил своё современное название — Национальный музей Таджикистана.
Общая площадь музея составляет 24 000 квадратных метров, из которых 15 000 отведено под экспозицию, разделённую на 22 зала. Здесь можно увидеть всё — от природных коллекций и древних артефактов эпохи Ахеменидов и Кушанского царства до полотен художников и личных подарков президенту страны от глав других государств. Среди самых ценных экспонатов — эллинистическая статуэтка сатира из Тахти-Сангина III–IV веков.