Cuando las fuerzas de Gengis Kan llegaron a estos muros, el asedio requirió un ejército de 25.000 hombres y 50.000 cautivos reunidos de toda Asia Central — tal era la fama de inexpugnable que tenía esta fortaleza. La heroica defensa de la fortaleza de Khujand estuvo encabezada por Temurmalik, y su resistencia frente a la invasión mongola se convirtió en uno de los capítulos más célebres de la lucha del pueblo tayiko por su libertad.
La fortaleza se estableció ya en los siglos VI-V a.C., primero como un terraplén de tierra y, más tarde, reconstruida como una poderosa muralla de adobe. La ciudad y la ciudadela contaban cada una con sus propias murallas independientes, rodeadas por un amplio foso de agua, y la Khujand medieval estaba considerada una de las ciudades más fortificadas de toda Asia Central.
La construcción que se conserva hoy es una reconstrucción moderna. El proyecto fue diseñado por el arquitecto tayiko Mansur Eshónov, inspirado en la obra de Ahmad Lahori — el arquitecto persa responsable del Taj Mahal. Para la decoración del complejo se fabricaron alrededor de 4.000 metros cuadrados de azulejos de mayólica, recuperando el oficio casi perdido de la decoración ornamental tradicional de Khujand. Hoy en día funciona aquí un museo que narra la historia de una de las ciudades más antiguas de Asia Central.
